การเพาะเห็ดในร่มขึ้นอยู่กับสภาพแวดล้อมที่มีการควบคุมอย่างระมัดระวัง เช่น ความชื้น อุณหภูมิ การไหลของอากาศ และองค์ประกอบของสารตั้งต้น เห็ดไม่ทำสังเคราะห์แสงและต่างจากพืช